Infekčním onemocněním mozku a jeho obalů se neurochirurgie primárně nezabývá. Léčba pomocí cílené antimikrobiální léčby spadá do kompetence oboru neurologie a infekčního lékařství. Chirurgické řešení je vhodné pouze v případě, že se intrakraniálně vytvoří opouzdřené ložisko hnisu, které je třeba vypustit a ošetřit okolní tkáně. Typicky se jedná o hnis mezi mozkem tvrdou plenou mozkovou (tzv. subdurální empyém), nebo hnisavé ložisko přímo v mozkové tkáni (tzv. mozkový absces).